从基因层面分析肺动脉高压发生潜在分子机制

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随着基因测序技术的发展，产生了大量的基因信息，肺动脉高压作基因芯片数据的发展已成为研究新趋势和热点。

扬州大学临床医医院王大新、仲红艳等利用基因表达数据库（CEO），筛选出可能参与肺动脉高压发生的关键基因和关键microRNA，为肺动脉高压的研究和治疗提供了新视角。

这项研究中，研究者从CEO下载了3个人肺组织来源的基因芯片，应用R语言和GEO2R筛选肺动脉高压患者与正常人肺组织中差异表达基因和差异表达microRNA，并通过DAVID6.8数据库进行基因功能分析和信号通路富集分析，STRING在线数据库构建蛋白之间相互作用可视化网络图（PPI），TargetScan数据库预测差异microRNA靶基因，Cytoscape3.6.1软件构建microRNA-mRNA网络。

结果获得个差异基因，其中个为上调基因，85个为下调基因。

这些差异基因主要涉及细胞趋化、炎症反应等生物学过程，主要参与造血细胞系、性别等方面的信号通路，从PPI中识别出10个关键基因HGF、KIT、VCAM1、CXCL12、ITGAM、FPR1、CXCL9、CXCR1、TLR8、CXCR2。

获得29个差异microRNA，构建了microRNA-mRNA网络，并从网络中识别出5个关键microRNA。

DAVID6.8在线分析这5个关键microRNA对应的差异靶基因，发现其主要参与细胞增殖、血管生成、炎症反应等过程，涉及的通路主要是肾素-血管紧张素系统、造血细胞系、磷脂酰肌醇-3-激酶/蛋白激酶B（PI3K/Akt）、Ras相关蛋白1（Rap1）信号通路等。

来源：仲红艳，唐珊，赵飞飞，等.肺动脉高压关键基因的筛选及生物信息学分析.中国循环杂志,,35:-.

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